RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 PROSER1Q86XN7 944 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PLA2G15Q8NCC3 412 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SCRN2Q96FV2 425 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 COQ10AQ96MF6 247 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 WDR92Q96MX6 357 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 KLQ9UEF7 1012 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 LMO7DNF2Z398 122 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PSMD11O00231 422 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 APOL1O14791 398 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SPOPO43791 374 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 GCATO75600 419 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ANXA6P08133 673 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 GM2AP17900 193 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CA4P22748 312 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 MAGEA1P43355 309 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ELOCQ15369 112 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ALG11Q2TAA5 492 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SLC9A4Q6AI14 798 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 HID1Q8IV36 788 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PLD5Q8N7P1 536 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 GLMNQ92990 594 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 NUS1Q96E22 293 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 U3KQA8 63 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TRABD2BA6NFA1 517 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 LCA5LO95447 670 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ALPIP09923 528 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TSHRP16473 764 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 KELP23276 732 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF75DP51815 510 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 HADHBP55084 474 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 C1orf61Q13536 156 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ARHGEF7Q14155 803 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SPA17Q15506 151 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 MDM1Q8TC05 714 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 RBSNQ9H1K0 784 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 WDR26Q9H7D7 661 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DKK4Q9UBT3 224 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CLCA2Q9UQC9 943 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PPIL1Q9Y3C6 166 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 FZD6O60353 706 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 HLA-DQB2P05538 268 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CTSEP14091 401 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 COMTP21964 271 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 LHCGRP22888 699 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 RPIAP49247 311 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DSC2Q02487 901 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.724e-6■■■■□ 21.9
PTPRS-209ENST00000591760 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DENND2CQ68D51 928 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 IFI44Q8TCB0 444 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 NXPE2Q96DL1 559 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 BOCQ9BWV1 1114 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DOLKQ9UPQ8 538 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PSTPIP1O43586 416 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PDHA1P08559 390 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 MYF5P13349 255 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TNNT1P13805 278 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 TRIM23P36406 574 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 EPHB1P54762 984 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 NR0B2Q15466 257 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 CDKN3Q16667 212 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 PNCKQ6P2M8 343 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 RD3Q7Z3Z2 195 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 RFX6Q8HWS3 928 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 LRRN4Q8WUT4 740 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRS-209ENST00000591760 DTD2Q96FN9 168 aa25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms