RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA6CQ9H3T2 930 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 AP4E1Q9UPM8 1137 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO18BQ8IUG5 2567 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP42A6NI28 874 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MX80 341 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK10P53779 464 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKB2Q00653 900 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALNT1Q00973 533 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2L1Q07817 233 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF7Q14155 803 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MANEAQ5SRI9 462 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF19Q5T6S3 580 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DCUN1D2Q6PH85 259 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK11Q8NG66 645 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR26Q9H7D7 661 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCLQ9NW38 375 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DONSONQ9NYP3 566 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MOSPD1Q9UJG1 213 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN8AQ9UQD0 1980 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS38A1L453 326 aa25.71■■□□□ 1.71
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CAPNS1-211ENST00000590874 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM87AP0C7U9 286 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB6P18564 788 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MAZP56270 477 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP9Q49MG5 647 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PNCKQ6P2M8 343 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DTX1Q86Y01 620 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NPWQ8N729 165 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 RDH14Q9HBH5 336 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 STARD5Q9NSY2 213 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GAT1O43505 415 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR5Q6UX68 686 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PAF1Q8N7H5 531 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PEBP4Q96S96 227 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SP110Q9HB58 689 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R14Q9NYV8 317 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 DFFAO00273 331 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP6O43182 974 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX33O43247 280 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4F2P78329 520 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOX1Q15067 660 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAD10Q6JQN1 1059 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RFX8Q6ZV50 586 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NRROSQ86YC3 692 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ10AQ96MF6 247 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT6Q9UBX8 382 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQC6 194 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS16A8MUM7 142 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNB1P14635 433 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC2P18074 760 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CSRP3P50461 194 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SCNN1BP51168 640 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1D5P58170 312 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TBR1Q16650 682 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 AMZ1Q400G9 498 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53INP2Q8IXH6 220 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR3CQ8WXA8 447 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PCSK1NQ9UHG2 260 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE6O95741 557 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 FUCA1P04066 466 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL4P13236 92 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 DESP17661 470 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA2P25787 234 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 IL10RBQ08334 325 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 MAMLD1Q13495 774 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
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