RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 CAPN8A6NHC0 703 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 LEFTY1O75610 366 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 BRAFP15056 766 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 CDKN3Q16667 212 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 SH2D5Q6ZV89 423 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 DENND6AQ8IWF6 608 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4K2Q8NGD2 314 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 UCMAQ8WVF2 138 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 EID2BQ96D98 161 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 MTBPQ96DY7 904 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 SERAC1Q96JX3 654 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 LYSMD1Q96S90 227 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM167BQ9BTA0 163 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNK12Q9HB15 430 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 TXNDC16Q9P2K2 825 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 IL36AQ9UHA7 158 aa26.09■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 APODP05090 189 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 HLA-EP13747 358 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 HNF1BP35680 557 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEP78395 509 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 TMPRSS15P98073 1019 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE1BQ01064 536 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 MROH9Q5TGP6 573 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR153Q6NV75 609 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 LRIG1Q96JA1 1093 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PQ67 120 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 ITGA2BP08514 1039 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 GABRB3P28472 473 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC1A2P43004 574 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 LIMK2P53671 638 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 ARSIQ5FYB1 569 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 C9orf64Q5T6V5 341 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF470Q6ECI4 717 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 C4orf33Q8N1A6 199 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SCRN2Q96FV2 425 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 STARD13Q9Y3M8 1113 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPAN11A1L157 253 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC162PA2VCL2 907 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 OR51F1A6NGY5 319 aa26.07■■□□□ 1.76
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SCAMP4-210ENST00000588555 MT-ND3P03897 115 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 FOSL2P15408 326 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT4P19013 534 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGCLP35914 325 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 IL12RB1P42701 662 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 GALK1P51570 392 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 CTBP1Q13363 440 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 TIFABQ6ZNK6 161 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 PAF1Q8N7H5 531 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 CALML6Q8TD86 181 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 PPM1EQ8WY54 764 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 HLA-CQ95604 372 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 IL17CQ9P0M4 197 aa26.07■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC4A1P02730 911 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 AHSGP02765 367 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRP35270 261 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
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SCAMP4-210ENST00000588555 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 BRAT1Q6PJG6 821 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 CNPY4Q8N129 248 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SMC6Q96SB8 1091 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SELENOSQ9BQE4 189 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SCN8AQ9UQD0 1980 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM120BA0PK00 339 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 MPP1Q00013 466 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 PPARDQ03181 441 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC3Q13217 504 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0408Q6ZU52 694 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDT18Q6ZVK8 323 aa26.05■■□□□ 1.76
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