RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 CT83Q5H943 113 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 TREML2Q5T2D2 321 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ABHD17BQ5VST6 288 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ICE2Q659A1 982 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ANKS6Q68DC2 871 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 AADACL2Q6P093 401 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 CYS1Q717R9 158 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC91Q7Z6B0 441 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 SESTD1Q86VW0 696 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 HACE1Q8IYU2 909 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 NME8Q8N427 588 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 RNF169Q8NCN4 708 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 BEST2Q8NFU1 509 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 MAML1Q92585 1016 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 MTBPQ96DY7 904 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP4Q96MN2 994 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 MCEEQ96PE7 176 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 TTC1Q99614 292 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 IFT22Q9H7X7 185 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 KLC4Q9NSK0 619 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 SYBUQ9NX95 663 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 DPP3Q9NY33 737 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 PAK5Q9P286 719 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 DNPEPQ9ULA0 475 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 KAT6AQ92794 2004 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 DOCK5Q9H7D0 1870 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRM-215ENST00000583289 PIPSLA2A3N6 862 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM23A6NLE4 172 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 LACTBL1A8MY62 500 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 HACD1B0YJ81 288 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 E7ESA3 106 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 F8VP50 259 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 AP3B1O00203 1094 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MDM4O15151 490 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CHADO15335 359 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TP73O15350 636 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 LRCH4O75427 683 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ENDOD1O94919 500 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 C22orf31O95567 290 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PDGFRAP16234 1089 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CYP3A5P20815 502 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ENPP1P22413 925 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CNTFP26441 200 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SDC4P31431 198 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TNFSF9P41273 254 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 GPD2P43304 727 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SLCO1A2P46721 670 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 AIF1P55008 147 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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PTPRM-215ENST00000583289 PRKG1Q13976 671 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 DPYSL3Q14195 570 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 KRT81Q14533 505 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PDCD1Q15116 288 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SNCBQ16143 134 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PDK4Q16654 411 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC38Q502W7 563 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 HHATQ5VTY9 493 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 KAZNQ674X7 775 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.65□□□□□ -1.67
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