RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN2D	P55273	166 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ACVR1	Q04771	509 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	IL10RB	Q08334	325 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LPIN1	Q14693	890 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PARP15	Q460N3	678 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	GPR158	Q5T848	1215 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PSMG2	Q969U7	264 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf60	Q96EN9	201 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GLP2R	O95838	553 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PBX3	P40426	434 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IL23R	Q5VWK5	629 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PAOX	Q6QHF9	649 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SATL1	Q86VE3	508 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GPR150	Q8NGU9	434 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CNBD2	Q96M20	576 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CD300A	Q9UGN4	299 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	LZTS1	Q9Y250	596 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TTC3	P53804	2025 aa		18.45	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	LDB2	O43679	373 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	EPO	P01588	193 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DPA1	P20036	260 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FDXR	P22570	491 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	USP46	P62068	366 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CLGN	O14967	610 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RAMP2	O60895	175 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FGF1	P05230	155 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FGF4	P08620	206 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OR4Q2	P0C623	313 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A1	P30825	629 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ARSD	P51689	593 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CREB5	Q02930	508 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MAP7	Q14244	749 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ADRM1	Q16186	407 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ALF	Q53S48	1182 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	LPGAT1	Q92604	370 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FEM1C	Q96JP0	617 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PADI4	Q9UM07	663 aa		18.44	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TRPA1	O75762	1119 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CNTN5	O94779	1100 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PGM3	O95394	542 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CYBA	P13498	195 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CD1D	P15813	335 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	NKX3-2	P78367	333 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	EFEMP1	Q12805	493 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	LSAMP	Q13449	338 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	USP41	Q3LFD5	358 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	UNC50	Q53HI1	259 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	DRGX	A6NNA5	263 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559		F8W810	466 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TFAP2A	P05549	437 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA11	P43364	429 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SUOX	P51687	545 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MTA1	Q13330	715 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	DDR2	Q16832	855 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		18.43	■□□□□ 0.54

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