RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562443.1

CFAP20-202, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

TSL 5

Gene CFAP20, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-202ENST00000562443 MYOD1P15172 320 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF44P15621 663 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 NPR1P16066 1061 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 EGR1P18146 543 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 BCL3P20749 454 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 GPX3P22352 226 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 PRKCHP24723 683 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ITGA3P26006 1051 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 YWHAQP27348 245 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 STX2P32856 288 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 PIGAP37287 484 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 MMP12P39900 470 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 WNT5AP41221 380 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 GPR12P47775 334 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 LMAN1P49257 510 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CLCNKAP51800 687 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 OAZ1P54368 228 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ADKP55263 362 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TAS2R50P59544 299 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ISL1P61371 349 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 HERV-K104P61576 105 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RAB1AP62820 205 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ARHGAP8P85298 464 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RHAGQ02094 409 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 FCHO2Q0JRZ9 810 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ITGADQ13349 1161 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 DRP2Q13474 957 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RUNX3Q13761 415 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CAPSQ13938 189 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CAMK1Q14012 370 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 EFNB3Q15768 340 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 PTPN21Q16825 1174 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 HLA-BQ31612 363 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 WLSQ5T9L3 541 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 MANEALQ5VSG8 457 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RNLSQ5VYX0 342 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 FAM90A2PQ658T7 463 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ANKRD40Q6AI12 368 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 OR7E24Q6IFN5 339 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TRNP1Q6NT89 227 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TTI2Q6NXR4 508 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TMEM88Q6PEY1 159 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 C16orf89Q6UX73 402 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TFAP2EQ6VUC0 442 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 C11orf96Q7Z7L8 435 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ISCA2Q86U28 154 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF354CQ86Y25 554 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 DENND6AQ8IWF6 608 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RBFAQ8N0V3 343 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 EID3Q8N140 333 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF611Q8N823 705 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 Q8NBF4 154 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ZBTB34Q8NCN2 500 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 OR52I2Q8NH67 350 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF519Q8TB69 540 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 KCNG4Q8TDN1 519 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 DUSP19Q8WTR2 217 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ABHD5Q8WTS1 349 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CHPT1Q8WUD6 406 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 FAR1Q8WVX9 515 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 OVCA2Q8WZ82 227 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TMEM143Q96AN5 459 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ESAMQ96AP7 390 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 DHX58Q96C10 678 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 GRAMD1AQ96CP6 724 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 NUS1Q96E22 293 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 ARSGQ96EG1 525 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 FAR2Q96K12 515 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 MRGPRX1Q96LB2 322 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 C2orf48Q96LS8 159 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 GMLQ99445 158 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 CMKLR1Q99788 373 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 RTP3Q9BQQ7 232 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 NEURL2Q9BR09 285 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 MSTO1Q9BUK6 570 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 KATNAL1Q9BW62 490 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa-0.02□□□□□ -2.41
CFAP20-202ENST00000562443 WWTR1Q9GZV5 400 aa-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms