RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2D4A	Q9H788	454 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	USP22	Q9UPT9	525 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF3A	Q9Y496	699 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		2.9	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPE2	198 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PR64	198 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRG0	241 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ18	B7U540	433 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF28P	B7ZC32	967 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AGPS	O00116	658 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF103	O00237	685 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GCAT	O75600	419 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DDHD2	O94830	711 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CER1	O95813	267 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MCM5	P33992	734 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CPOX	P36551	454 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC26A5	P58743	744 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	UFM1	P61960	85 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMC6	P62333	389 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARF5	P84085	180 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RPA4	Q13156	261 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CBX3	Q13185	183 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA7	Q13683	1181 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ALCAM	Q13740	583 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBB2A	Q13885	445 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ12	Q14500	433 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNAB1	Q14722	419 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG11	Q2TAA5	492 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MPP7	Q5T2T1	576 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	JADE1	Q6IE81	842 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TTI2	Q6NXR4	508 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC73	Q6P1J9	531 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DEF8	Q6ZN54	512 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PELI3	Q8N2H9	469 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP53	Q96M91	514 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD1	Q96SE0	405 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP5K1A	Q99755	562 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP9	Q9H5L6	903 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		2.9	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQF6	199 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBC2	A0A5B9	178 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2A25	A4D2G3	310 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LACTBL1	A8MY62	500 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		B4DGG1	531 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF263	O14978	683 aa		2.89	□□□□□ -1.95

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