RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	TISP43	B9A030	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CTAGE5	O15320	804 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KRT38	O76015	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KAT7	O95251	611 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MBD3	O95983	291 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GH1	P01241	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CYBA	P13498	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PTMS	P20962	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP1	P28562	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CASP1	P29466	404 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SFN	P31947	248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	VPS41	P49754	854 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LBX1	P52954	281 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CNGA3	Q16281	694 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	UGCG	Q16739	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HYI	Q5T013	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MYMK	A6NI61	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		B9A039	149 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		H0Y3Z8	333 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NKX2-8	O15522	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT4	O43236	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PROP1	O75360	226 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LYPLA2	O95372	231 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	STAT6	P42226	847 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRMT2	P55345	433 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PROK1	P58294	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PSMC5	P62195	406 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	BEX3	Q00994	111 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PNOC	Q13519	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CBFB	Q13951	182 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ANO5	Q75V66	913 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RAD54L	Q92698	747 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAR2	Q96K12	515 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LXN	Q9BS40	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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