RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 GRK6P43250 576 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 EPHB1P54762 984 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 WASHC5Q12768 1159 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 FZD2Q14332 565 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ACTL9Q8TC94 416 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SMIM14Q96QK8 99 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.99■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 HACD1B0YJ81 288 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 MTSS1O43312 755 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SDC3O75056 442 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TJP3O95049 919 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PCCBP05166 539 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ITGAVP06756 1048 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 HNF1BP35680 557 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 BNIP3Q12983 259 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 XRCC4Q13426 336 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ACOX1Q15067 660 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TEKT5Q96M29 485 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 COQ10AQ96MF6 247 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 GLOD4Q9HC38 313 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.98■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0J9YYE9 177 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0U1RQS6 177 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 H7C0C1 242 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TRBC1P01850 177 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ATP5OP48047 213 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 THOP1P52888 689 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 INAVAQ3KP66 663 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 DENND2CQ68D51 928 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PARGQ86W56 976 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 IFT43Q96FT9 208 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 CAPN8A6NHC0 703 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TOR1BO14657 336 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ADRB1P08588 477 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 YPEL5P62699 121 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 MTM1Q13496 603 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGEF7Q14155 803 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 INPP5AQ14642 412 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC66Q68CR7 880 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 TADA1Q96BN2 335 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 NUS1Q96E22 293 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.96■□□□□ 0.95
TMOD3-203ENST00000558455 PSMD11O00231 422 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 NFKB1P19838 968 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 RBL1P28749 1068 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 ETV3P41162 512 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 FOXK2Q01167 660 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 PTK2BQ14289 1009 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 SLC14A2Q15849 920 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 PCSK7Q16549 785 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 QPCTQ16769 361 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 MACC1Q6ZN28 852 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF567Q8N184 647 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 DTD2Q96FN9 168 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 TRIB3Q96RU7 358 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 VAT1Q99536 393 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 OR1A2Q9Y585 309 aa20.95■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 PIAS2O75928 621 aa20.94■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 CSF2P04141 144 aa20.94■□□□□ 0.94
TMOD3-203ENST00000558455 RBP3P10745 1247 aa20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms