RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NDUFS7	O75251	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CD58	P19256	250 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	STX2	P32856	288 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NAE1	Q13564	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ASIC2	Q16515	512 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SOCS6	O14544	535 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TBX18	O95935	607 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CD4	P01730	458 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CDA	P32320	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ART1	P52961	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PERP	Q96FX8	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	UTY	O14607	1347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ACOT8	O14734	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CLDN14	O95500	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SPARC	P09486	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	IL7R	P16871	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DDIT3	P35638	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PEX5	P50542	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DLG1	Q12959	904 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591		B4E171	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SEC14L2	O76054	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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