RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555068.1

AC004825.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004825.1, Length 586 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004825.1-201ENST00000555068 CLMPQ9H6B4 373 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SGK2Q9HBY8 427 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 GDF3Q9NR23 364 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 MKS1Q9NXB0 559 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 PRSS50Q9UI38 385 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 CEP83Q9Y592 693 aa5.66□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 MOCS3O95396 460 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TBX18O95935 607 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 RPN1P04843 607 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 MTHFD2P13995 350 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 CSF2RBP32927 897 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 NNMTP40261 264 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 IL12RB1P42701 662 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ASIC1P78348 528 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 NUCB2P80303 420 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 E2F1Q01094 437 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 IL9RQ01113 521 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 EFEMP1Q12805 493 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ILKQ13418 452 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SPIDRQ14159 915 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TOR2AQ5JU69 321 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 HES3Q5TGS1 186 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 UNC93AQ86WB7 457 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 LSMEM2Q8N112 164 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 EID2Q8N6I1 236 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 GOLGA5Q8TBA6 731 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 EPSTI1Q96J88 318 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 FIZ1Q96SL8 496 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 DNAI1Q9UI46 699 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SCML1Q9UN30 329 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 SCML2Q9UQR0 700 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
AC004825.1-201ENST00000555068 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 SPEGQ15772 3267 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 KCNJ18B7U540 433 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3LB9A6J9 549 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 VILLO15195 856 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CLIC2O15247 247 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 ARHGAP6O43182 974 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 NRP2O60462 931 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 STC2O76061 302 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CISD3P0C7P0 127 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 ALPPL2P10696 532 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CCND1P24385 295 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CD38P28907 300 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 ACSL1P33121 698 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 RRADP55042 308 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 MFAP3P55082 362 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 CYP24A1Q07973 514 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 ST3GAL1Q11201 340 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 PSMD6Q15008 389 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 PCOLCEQ15113 449 aa5.64□□□□□ -1.51
AC004825.1-201ENST00000555068 RABEP1Q15276 862 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms