RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OR8K5Q8NH50 307 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC9A6Q92581 669 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SGCDQ92629 289 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MOAP1Q96BY2 351 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DHX58Q96C10 678 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C14orf79Q96F83 325 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FAR2Q96K12 515 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RMDN2Q96LZ7 410 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ZBTB18Q99592 522 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAD9AQ99638 391 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CCT7Q99832 543 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 INPP5KQ9BT40 448 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TTYH3Q9C0H2 523 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GPR88Q9GZN0 384 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAB17Q9H0T7 212 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PLK3Q9H4B4 646 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAB20Q9NX57 234 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SPG21Q9NZD8 308 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAB21Q9UL25 225 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GABRQQ9UN88 632 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SPACA6W5XKT8 324 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 H0YIN7 160 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PPEF2O14830 753 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 N4BP3O15049 544 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CLIC2O15247 247 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GPRIN2O60269 458 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CACNG3O60359 315 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 HSF2BPO75031 334 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TACC1O75410 805 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SCGB2A1O75556 95 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PRDM1O75626 825 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC25A12O75746 678 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CIB2O75838 187 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAD17O75943 681 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 HAUS5O94927 633 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ZBTB7AO95365 584 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NPPAP01160 153 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RLN1P04808 185 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SERPING1P05155 500 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CHRM4P08173 479 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 IRF1P10914 325 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PNLIPP16233 465 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 VCLP18206 1134 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ADRA2CP18825 462 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 HK1P19367 917 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TNFRSF1AP19438 455 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NR1D1P20393 614 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SDHBP21912 280 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NR2F2P24468 414 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DNAJB1P25685 340 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MGAT1P26572 445 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RBL1P28749 1068 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PRKAR1BP31321 381 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MCM5P33992 734 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GDNFP39905 211 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ABCG1P45844 678 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KCNJ1P48048 391 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PGDP52209 483 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DGKEP52429 567 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GALCP54803 685 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CD83Q01151 205 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ACY1Q03154 408 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DUSP2Q05923 314 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TCF15Q12870 199 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GIT2Q14161 759 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NEDD9Q14511 834 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 LPIN1Q14693 890 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms