RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 NUP205Q92621 2012 aa7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 MEI4A8MW99 385 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 SH3BP5O60239 455 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 OPHN1O60890 802 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 NDUFS2O75306 463 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 RHOBTB3O94955 611 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 SERPINF2P08697 491 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 RALAP11233 206 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 CD59P13987 128 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 CD19P15391 556 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 RGS7P49802 495 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 MXI1P50539 228 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 TPMTP51580 245 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 KRT85P78386 507 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 BNC1Q01954 994 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 ADIGQ0VDE8 80 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 GRIK2Q13002 908 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 SEMA3BQ13214 749 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF234Q14588 700 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 KRT39Q6A163 491 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 PIP4P1Q86T03 277 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 LILRB2Q8N423 598 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 DDI1Q8WTU0 396 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 SNX19Q92543 992 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 KAT5Q92993 513 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 WDR92Q96MX6 357 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.15□□□□□ -1.26
GNPTAB-209ENST00000552009 ITPR1Q14643 2758 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM170AA1A519 330 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 E7ENQ6 273 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TAF4O00268 1085 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PEX11BO96011 259 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CD6P30203 668 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PRCPP42785 496 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 COPAP53621 1224 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 GAGE13Q4V321 117 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TFAP2BQ92481 460 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC32A1Q9H598 525 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 RAB20Q9NX57 234 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.14□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A1B0GVT2 93 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MAPK13O15264 365 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF217O75362 1048 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 GJB3O75712 270 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ZBED1O96006 694 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 HLA-FP30511 346 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC6A4P31645 630 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CD70P32970 193 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ACSL1P33121 698 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MAN2A2P49641 1150 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CLDN6P56747 220 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 IL9RQ01113 521 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms