RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RAB2AP61019 212 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RAB5BP61020 215 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BIKQ13323 160 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK1Q14012 370 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK11Q15759 364 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KYNUQ16719 465 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PARP6Q2NL67 630 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SNX20Q7Z614 316 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CEP97Q8IW35 865 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 POC5Q8NA72 575 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OXER1Q8TDS5 423 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD6Q96KE9 485 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ECSITQ9BQ95 431 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HGH1Q9BTY7 390 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PLK2Q9NYY3 685 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM149AA5PLN7 773 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PSMG1O95456 288 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HMBSP08397 361 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SRCP12931 536 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 POU2F1P14859 743 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DPA1P20036 260 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 S100PP25815 95 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RGS6P49758 472 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MYL6P60660 151 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PTK6Q13882 451 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PDK2Q15119 407 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MYLIPQ8WY64 445 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EXT2Q93063 718 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AGPAT1Q99943 283 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OMDQ99983 421 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FUOMA2VDF0 154 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM187AA6NFU0 413 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TSTD3H0UI37 97 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA7P01567 189 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CTSEP14091 401 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HPGDP15428 266 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRADDQ15628 312 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GAD1Q99259 594 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VPS45Q9NRW7 570 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM22K7EJ46 135 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SRGAP2O75044 1071 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM163BP0C2L3 166 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SOX6P35712 828 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NUDT1P36639 197 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GP5P40197 560 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GATMP50440 423 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AIF1P55008 147 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CDH6P55285 790 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RHOAP61586 193 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 STAT4Q14765 748 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LILRB2Q8N423 598 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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