RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	POC5	Q8NA72	575 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGK	Q92643	395 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	RITA1	Q96K30	269 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A17	O43808	307 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	JTB	O76095	146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TF	P02787	698 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT1	P04628	370 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRC2	P26717	231 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CDA	P32320	146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NRIP1	P48552	1158 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	YPEL5	P62699	121 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIK3	Q13003	919 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	RUNX2	Q13950	521 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMD6	Q15008	389 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PGM5	Q15124	567 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CADM3	Q8N126	398 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC14	Q96N46	770 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CTDSP2	O14595	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC14L5	O43304	696 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NEURL1	O76050	574 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NFATC1	O95644	943 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA4L	O95757	839 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PLAU	P00749	431 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGAX	P20702	1163 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	CHRNA5	P30532	468 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	RYK	P34925	604 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC15A1	P46059	708 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRB2	P47870	512 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PMS2	P54278	862 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	UBXN2A	P68543	259 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	OLIG2	Q13516	323 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT3	Q14435	633 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	NTRK2	Q16620	822 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	KYNU	Q16719	465 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG1-222	ENST00000545308	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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