RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	DLG2	Q15700	870 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ART4	Q93070	314 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TACR2	P21452	398 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	COL1A2	P08123	1366 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606		E7ENQ6	273 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LRIG2	O94898	1065 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	UQCRB	P14927	111 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SSR2	P43308	183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	PSME3	P61289	254 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	DSC2	Q02487	901 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CCL14	Q16627	93 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TBATA	Q96M53	351 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TK2	O00142	265 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LMO2	P25791	158 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ARL2	P36404	184 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	URAD	A6NGE7	173 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606		E9PAM4	449 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GNRH1	P01148	92 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606		H3BM21	787 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM24	O15164	1050 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ALOX15B	O15296	676 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SLC31A1	O15431	190 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	FFAR2	O15552	330 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RGS1	Q08116	209 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RFXANK	O14593	260 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	BCL10	O95999	233 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ITPKB	P27987	946 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	C21orf59	P57076	290 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	USP46	P62068	366 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.27	□□□□□ -0.28

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