RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 GJB3O75712 270 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL2O95198 593 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINF2P08697 491 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GLRBP48167 497 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 IDH3AP50213 366 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN5P51795 746 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PGGT1BP53609 377 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TAS2R39P59534 338 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAMEP78395 509 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.34■□□□□ 0.85
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PACSIN3-211ENST00000539589 CNSTQ6PJW8 725 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SPON2Q9BUD6 331 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RFXAPO00287 272 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GSC2O15499 205 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 KDELR3O43731 214 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF19O95750 216 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 NRIP1P48552 1158 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 OXCT1P55809 520 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBB3Q13509 450 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF460Q14592 562 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP6Q16828 381 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RINLQ6ZS11 566 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TREML1Q86YW5 311 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CPXM2Q8N436 756 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 AGAP11Q8TF27 550 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX13Q92968 403 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 OMDQ99983 421 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH19Q9H159 772 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF195O14628 629 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LDB2O43679 373 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAMEF12O95522 483 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SBK3P0C264 359 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC14A2Q15849 920 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP157Q5JU67 520 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MAVSQ7Z434 540 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC10Q969S8 669 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NXNL1Q96CM4 212 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR78Q96P69 363 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MGME1Q9BQP7 344 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 AURKAO14965 403 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CEBPBP17676 345 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ASPHQ12797 758 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNC3Q14003 757 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX9Q8N6V9 391 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PSKH2Q96QS6 385 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DRC3Q9H069 523 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PLK2Q9NYY3 685 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 XPR1Q9UBH6 696 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 BPTFQ12830 3046 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TARM1B6A8C7 271 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 H0Y626 953 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CD160O95971 181 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 POU2F2P09086 479 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIA4P48058 902 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RCN2Q14257 317 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LEMD2Q8NC56 503 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC8Q8TAM2 541 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ING5Q8WYH8 240 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG14Q96F25 216 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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