RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 TRBC1P01850 177 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 CSF2P04141 144 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 ELFN1P0C7U0 828 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 IL9RQ01113 521 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 MTM1Q13496 603 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 NOMO1Q15155 1222 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 PEX26Q7Z412 305 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 SLC25A45Q8N413 288 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 TRIB3Q96RU7 358 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 LRP4O75096 1905 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 ITGAVP06756 1048 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 GIMD1P0DJR0 217 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 DGKAP23743 735 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 HNF1BP35680 557 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 SHC2P98077 582 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 CDKN3Q16667 212 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 INAVAQ3KP66 663 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 PARGQ86W56 976 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 TBATAQ96M53 351 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 VAT1Q99536 393 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 GLOD4Q9HC38 313 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 KLF15Q9UIH9 416 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 CHKBQ9Y259 395 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PKP3-211ENST00000534401 KRT86O43790 486 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PIAS2O75928 621 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 NEBLO76041 1014 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CA4P22748 312 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CD86P42081 329 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PTK2BQ14289 1009 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 INPP5AQ14642 412 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PTPRRQ15256 657 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 MACC1Q6ZN28 852 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 USP45Q70EL2 814 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 NLRP8Q86W28 1048 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 APOOQ9BUR5 198 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 KNTC1P50748 2209 aa21.39■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CAPN8A6NHC0 703 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 TNFSF14O43557 240 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 FTCDO95954 541 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 ZNF30P17039 623 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 TEAD1P28347 426 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.011e-8■■■■□ 22.4
PKP3-211ENST00000534401 PTSQ03393 145 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 QPCTQ16769 361 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 AADACL2Q6P093 401 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 ACTL9Q8TC94 416 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 DTD2Q96FN9 168 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 AGAP3Q96P47 875 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 SMIM14Q96QK8 99 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CEP41Q9BYV8 373 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 A8MX80 341 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 ALPIP09923 528 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CTPS1P17812 591 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 CETN2P41208 172 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 DPTQ07507 201 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PELI3Q8N2H9 469 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PAF1Q8N7H5 531 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.015e-6■■□□□ 11.5
PKP3-211ENST00000534401 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP3-211ENST00000534401 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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