RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522010.1

VDAC3-208, Transcript of voltage dependent anion channel 3, human

TSL 5

Gene VDAC3, Length 631 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VDAC3-208	ENST00000522010	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CLIC2	O15247	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	OGG1	O15527	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CYP27B1	O15528	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TXNL1	O43396	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	FOXS1	O43638	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	BCL10	O95999	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	KLKB1	P03952	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	PRLR	P16471	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ADRA2C	P18825	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ACHE	P22303	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	SHMT1	P34896	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CENPA	P49450	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	VPS41	P49754	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	NT5C2	P49902	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	GPC3	P51654	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TAS2R40	P59535	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ASIC1	P78348	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	HHEX	Q03014	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	KLF10	Q13118	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	DLG2	Q15700	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010		Q6ZSN1	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CADM3	Q8N126	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	IP6K1	Q92551	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	EGFL8	Q99944	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	MST1R	Q04912	1400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	RFXAP	O00287	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VDAC3-208	ENST00000522010	NDC80	O14777	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms