RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NAT16Q8N8M0 369 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 HCAR2Q8TDS4 363 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF347Q96SE7 839 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 H0YJX3 145 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RB1P06400 928 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NAT2P11245 290 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MYL4P12829 197 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PRKCAP17252 672 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PRKACBP22694 351 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CLCNKBP51801 687 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RALGDSQ12967 914 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PSMD5Q16401 504 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 EPGNQ6UW88 154 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TP53INP1Q96A56 240 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL18Q96ME1 805 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 STRA6Q9BX79 667 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NT5C1AQ9BXI3 368 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 EPS8L2Q9H6S3 715 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MKS1Q9NXB0 559 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ADA2Q9NZK5 511 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 BPTFQ12830 3046 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 KMOO15229 486 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FGF18O76093 207 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 VAPBO95292 243 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINE1P05121 402 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GABRB2P47870 512 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PTK2BQ14289 1009 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1JQ5JR12 505 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TTC23LQ6PF05 361 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CBR4Q8N4T8 237 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MCEEQ96PE7 176 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TCF25Q9BQ70 676 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 HACD3Q9P035 362 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FAM149AA5PLN7 773 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN25C9JDP6 229 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GLDCP23378 1020 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ITGB8P26012 769 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GRIK1P39086 918 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PRKCQQ04759 706 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 DSC3Q14574 896 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SPCS2Q15005 226 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 UBXN11Q5T124 520 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NAPRTQ6XQN6 538 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SPERTQ8NA61 448 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP90Q8TF47 636 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 AP4E1Q9UPM8 1137 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ILVBLA1L0T0 632 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RGS13O14921 159 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM44O43615 452 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PLIN3O60664 434 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CRYZL1O95825 349 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FYNP06241 537 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NCAM1P13591 858 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ADORA2BP29275 332 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SLC11A1P49279 550 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TTC34A8MYJ7 566 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GALTP07902 379 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms