RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ITIH4Q14624 930 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 PPM1JQ5JR12 505 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SPATA21Q7Z572 469 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 VPS39Q96JC1 886 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 PRRT4C9JH25 899 aa14.54□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 AHSGP02765 367 aa14.54□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 HLA-DPA1P20036 260 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 TYK2P29597 1187 aa14.54□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 SLC20A2Q08357 652 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 CTBP1Q13363 440 aa14.54□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.54□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 TERB1Q8NA31 727 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.54□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 IFT43Q96FT9 208 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 INSIG1O15503 277 aa14.53□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 KAT7O95251 611 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 NDST3O95803 873 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 GSRP00390 522 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 PRKCGP05129 697 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 BGNP21810 368 aa14.53□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 DLG2Q15700 870 aa14.53□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 GPR22Q99680 433 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 MECRQ9BV79 373 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 RHOJQ9H4E5 214 aa14.53□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 FAM50BQ9Y247 325 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 KCTD3Q9Y597 815 aa14.53□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 TTC34A8MYJ7 566 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 GLRA3O75311 464 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 IGSF6O95976 241 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 PRLP01236 227 aa14.52□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 CES1P23141 567 aa14.52□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 NEPROQ6NW34 567 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 C16orf46Q6P387 395 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 Q6ZVU0 165 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SRLQ86TD4 932 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ZNF366Q8N895 744 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 CHKBQ9Y259 395 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.52□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PLIN3O60664 434 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 APODP05090 189 aa14.52□□□□□ -0.09
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