RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087WV48 116 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKR1B10O60218 316 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRINP1O60477 761 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGM2P21980 687 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VIPR1P32241 457 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAF2Q12933 501 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDK2Q15119 407 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PERM1Q5SV97 790 aa23.38■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 LVRNQ6Q4G3 990 aa23.38■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa23.38■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MOSPD1Q9UJG1 213 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR34Q9UPC5 381 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RP1P56715 2156 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM202A6NGA9 273 aa23.37■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K6O95382 1288 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTN2P35609 894 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GALNT2Q10471 571 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MESDQ14696 234 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNGA3Q16281 694 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNCKQ6P2M8 343 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDZD3Q86UT5 571 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 COQ10AQ96MF6 247 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEMA3CQ99985 751 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF670Q9BS34 389 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR26Q9H7D7 661 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP4O75096 1905 aa23.37■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCRN2Q96FV2 425 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.36■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MATN3O15232 486 aa23.35■■□□□ 1.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCTD16Q68DU8 428 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP45Q70EL2 814 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF8Q7Z7C8 310 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PELI3Q8N2H9 469 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KYQ8NBH2 561 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC42Q96M95 316 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
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