RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC9Q92623 222 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IGSF21Q96ID5 467 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZIM3Q96PE6 472 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 USP28Q96RU2 1077 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CNPY3Q9BT09 278 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PADI4Q9UM07 663 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A17O43808 307 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 OCM2P0CE71 109 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 ACTR1AP61163 376 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NEK8Q86SG6 692 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 YAF2Q8IY57 180 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA4Q8NEY3 305 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SUSD6Q92537 303 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC10Q969S8 669 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TAMM41Q96BW9 452 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SYBUQ9NX95 663 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 LAMTOR5O43504 91 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 CD300CQ08708 224 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 WDR93Q6P2C0 686 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RTL4Q6ZR62 310 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR149Q86SP6 731 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TBCKQ8TEA7 893 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CASD1Q96PB1 797 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NACC1Q96RE7 527 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 APOL6Q9BWW8 343 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.6□□□□□ -1.67
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