RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PJA1Q8NG27 643 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 GMIPQ9P107 970 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SCOCQ9UIL1 159 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TK2O00142 265 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CCL22O00626 93 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MAP3K13O43283 966 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MAFKO60675 156 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PEX11AO75192 247 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CNTN5O94779 1100 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SERPINE1P05121 402 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CALB2P22676 271 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ETFBP38117 255 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CCR10P46092 362 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB8P50452 374 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 COG7P83436 770 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 EML3Q32P44 896 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 GLRX5Q86SX6 157 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SGF29Q96ES7 293 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SCYL1Q96KG9 808 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TBATAQ96M53 351 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 VAT1Q99536 393 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 IL22Q9GZX6 179 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TASP1Q9H6P5 420 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 GLOD4Q9HC38 313 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NT5MQ9NPB1 228 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KRT34O76011 436 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PGM1P36871 562 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NPY2RP49146 381 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CLCN2P51788 898 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 OTUB2Q96DC9 234 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FAM161BQ96MY7 647 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TLK1Q9UKI8 766 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SOX13Q9UN79 622 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NEU3Q9UQ49 428 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RAD54BQ9Y620 910 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 J3KR12 359 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 HSPA4LO95757 839 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-25P01717 112 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 AHSGP02765 367 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CPB1P15086 417 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CCNCP24863 283 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PEX6Q13608 980 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MUM1Q2TAK8 710 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ALFQ53S48 1182 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ABI1Q8IZP0 508 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MYADMQ96S97 322 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CORO1BQ9BR76 489 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 THTPAQ9BU02 230 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FBRSQ9HAH7 460 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms