RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ZWILCHQ9H900 591 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR27Q9NS67 375 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 U3KQA8 63 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ATMQ13315 3056 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A0U1RQS6 177 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 FAM229AH3BQW9 127 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 DAPK3O43293 454 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TSPAN6O43657 245 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GCATO75600 419 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RFPL3O75679 317 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 IGSF6O95976 241 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 IL4RP24394 825 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 NUDT1P36639 197 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 HES3Q5TGS1 186 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RFX8Q6ZV50 586 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SRLQ86TD4 932 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PGBD5Q8N414 524 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SMIM14Q96QK8 99 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 A6NNZ2 444 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 MAP3K6O95382 1288 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ALBP02768 609 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CSF2P04141 144 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GYPCP04921 128 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 NID1P14543 1247 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CASP14P31944 242 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SOX11P35716 441 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 IRF4Q15306 451 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PARP15Q460N3 678 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 FIGNQ5HY92 759 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 OXR1Q8N573 874 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.37□□□□□ -1.23
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