RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CPT1BQ92523 772 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 LYSMD1Q96S90 227 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 FMO2Q99518 471 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 APPL1Q9UKG1 709 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HCN2Q9UL51 889 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 C5orf42Q9H799 3197 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MEI4A8MW99 385 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TOR1BO14657 336 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 WNT9AO14904 365 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEC1O60732 1142 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SPAG6O75602 509 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GNSP15586 552 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TIMP2P16035 220 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ADRA1AP35348 466 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 HMGCLP35914 325 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ABL2P42684 1182 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRAMEP78395 509 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ACOX1Q15067 660 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 QPCTQ16769 361 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PALM2Q8IXS6 379 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 AADATQ8N5Z0 425 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS33Q8NF86 280 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 STYXQ8WUJ0 223 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ART4Q93070 314 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ARRDC3Q96B67 414 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TTC25Q96NG3 672 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TRIB3Q96RU7 358 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RANBP9Q96S59 729 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CASS4Q9NQ75 786 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SARDHQ9UL12 918 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 DMTF1Q9Y222 760 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF711Q9Y462 761 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CKAP5Q14008 2032 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MUC3AQ02505 3323 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRR23AA6NEV1 266 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 USP12O75317 370 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SLC4A1P02730 911 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PDHA1P08559 390 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GSTA2P09210 222 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CTPS1P17812 591 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 AKT2P31751 481 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 DRD3P35462 400 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 HNF1BP35680 557 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MMP12P39900 470 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 LIG3P49916 1009 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CCR5P51681 352 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ADPRHP54922 357 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ITGA9Q13797 1035 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GAS6Q14393 721 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SPARCL1Q14515 664 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 POU6F1Q14863 301 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ANGPT1Q15389 498 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 BBS9Q3SYG4 887 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 AGBL4Q5VU57 503 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 DENND2CQ68D51 928 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC25Q86WR0 208 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM69Q86WT6 500 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms