RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0J9YYE9 177 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1B0GTQ1 180 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CFAP69A5D8W1 941 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TRBC1P01850 177 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF883P0CG24 379 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CA4P22748 312 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 HNF1BP35680 557 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CCT8P50990 548 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 EPHB1P54762 984 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TPRG1LQ5T0D9 272 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 USP45Q70EL2 814 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM58Q8NG06 486 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TADA1Q96BN2 335 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 UBP1Q9NZI7 540 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PFN3P60673 137 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC14Q15048 493 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 AGERQ15109 404 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PCSK7Q16549 785 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 HS1BP3Q53T59 392 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SEL1L2Q5TEA6 688 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DENND2CQ68D51 928 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PIP4P1Q86T03 277 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DEFB124Q8NES8 71 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNA4P22459 653 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC14A1Q13336 389 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 GALNT3Q14435 633 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ACOX1Q15067 660 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PID1Q7Z2X4 250 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KDELC2Q7Z4H8 507 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM174AQ8TBP5 190 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 COQ10AQ96MF6 247 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIB3Q96RU7 358 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TLR10Q9BXR5 811 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 GIPC1O14908 333 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SH3BP5O60239 455 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PCCBP05166 539 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 NFKBIAP25963 317 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RABIFP47224 123 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 QPCTQ16769 361 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PLA2G15Q8NCC3 412 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 VAT1Q99536 393 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KCND1Q9NSA2 647 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CAPN8A6NHC0 703 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNN4O15554 427 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DFNA5O60443 496 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PMPCBO75439 489 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RPL26P61254 145 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC66Q68CR7 880 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 GATAD2AQ86YP4 633 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 NAXDQ8IW45 347 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TTC13Q8NBP0 860 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 LRP4O75096 1905 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 BNIP3Q12983 259 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGEF7Q14155 803 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 FZD2Q14332 565 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC14A2Q15849 920 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RFLNAQ6ZTI6 216 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PELI3Q8N2H9 469 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 OXR1Q8N573 874 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ATG4AQ8WYN0 398 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CARD9Q9H257 536 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 USP29Q9HBJ7 922 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 TRHDEQ9UKU6 1024 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 BTBD3Q9Y2F9 522 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PCNX2A6NKB5 2137 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD66B4E2M5 251 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNK5O95279 499 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 C1SP09871 688 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ETV3P41162 512 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RXRGP48443 463 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 INPP5AQ14642 412 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF542PQ5EBM4 170 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PPM1JQ5JR12 505 aa26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms