RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481799.5

GGTA1P-203, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTA1P, Length 1,487 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-203ENST00000481799 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 SIX5Q8N196 739 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 OR2T3Q8NH03 318 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 FOXQ1Q9C009 403 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.72■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 BPTFQ12830 3046 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 SPAG6O75602 509 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 AADATQ8N5Z0 425 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 HACD3Q9P035 362 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 IL17CQ9P0M4 197 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.71■■□□□ 1.23
GGTA1P-203ENST00000481799 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 FAM159BA6NKW6 160 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CLDN7O95471 211 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 PSMD8P48556 350 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 RALGDSQ12967 914 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CST6Q15828 149 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CFAP58Q5T655 872 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 PEX13Q92968 403 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ZBTB9Q96C00 473 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 HDAC8Q9BY41 377 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 TRABDQ9H4I3 376 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.7■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CCL22O00626 93 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 AREL1O15033 823 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 MID1O15344 667 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CRTAMO95727 393 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 HMGCLP35914 325 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 PTSQ03393 145 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ZNF844Q08AG5 666 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ALS2CLQ60I27 953 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SDE2Q6IQ49 451 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 STYXQ8WUJ0 223 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 GGT7Q9UJ14 662 aa22.69■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 A8MX80 341 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 TCEA3O75764 348 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 MMP12P39900 470 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 P2RY2P41231 377 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CNTN1Q12860 1018 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 USP45Q70EL2 814 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 TTC7BQ86TV6 843 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CERS2Q96G23 380 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SHDQ96IW2 340 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 EURLQ9NYK6 297 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ITM2BQ9Y287 266 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.68■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 FAM170BA6NMN3 283 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ATP8B1O43520 1251 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ERVK-10P10266 1014 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ADRB3P13945 408 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 GM2AP17900 193 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 PHBP35232 272 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ZXDAP98168 799 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 CRY1Q16526 586 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 EOGTQ5NDL2 527 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 LRRC66Q68CR7 880 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 DPPA4Q7L190 304 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.67■■□□□ 1.22
GGTA1P-203ENST00000481799 TBATAQ96M53 351 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms