RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 EBF2Q9HAK2 575 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 FZD3Q9NPG1 666 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 NUMA1Q14980 2115 aa8.86□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TM7SF2O76062 418 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN7O95471 211 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 FGF1P05230 155 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TPH1P17752 444 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CD27P26842 260 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ADCY8P40145 1251 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 NBL1P41271 181 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 GRIA1P42261 906 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CCR5P51681 352 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CREB5Q02930 508 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SGCGQ13326 291 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PTK6Q13882 451 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 FGL2Q14314 439 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ACOX1Q15067 660 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PIGKQ92643 395 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SERAC1Q96JX3 654 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PHOX2BQ99453 314 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF711Q9Y462 761 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.85□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 BPTFQ12830 3046 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PPC4 97 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 C10orf142B7Z368 130 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 AURKAO14965 403 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 RAD51BO15315 384 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 RAD51CO43502 376 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 LATO43561 262 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SUN1O94901 812 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 C1SP09871 688 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CTAGE8P0CG41 777 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF30P17039 623 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 GM2AP17900 193 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TPSB2P20231 275 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ETV3P41162 512 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN2P57739 230 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 NHLH1Q02575 133 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 PTSQ03393 145 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 MTM1Q13496 603 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 KCNJ11Q14654 390 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 TPSAB1Q15661 275 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC6Q16204 474 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CDKN3Q16667 212 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 Q6ZVL8 140 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 LINC00523Q86TU6 105 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 MNS1Q8NEH6 495 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CPT1BQ92523 772 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 COQ10AQ96MF6 247 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 SLC6A18Q96N87 628 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 LYSMD1Q96S90 227 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 CARD6Q9BX69 1037 aa8.84□□□□□ -0.99
CASQ1-202ENST00000467691 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms