RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 SGF29Q96ES7 293 aa22.7■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.7■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.7■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 A8MX80 341 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 B4DGG1 531 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 PRAMEF10O60809 474 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 LIPCP11150 499 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 KELP23276 732 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 ETV5P41161 510 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 SLITRK4Q8IW52 837 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 TMEM159Q96B96 161 aa22.69■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 CLMPQ9H6B4 373 aa22.69■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.68■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 UBXN1Q04323 297 aa22.68■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.68■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.68■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 B4GAT1O43505 415 aa22.67■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 DESP17661 470 aa22.67■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 ERCC2P18074 760 aa22.67■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 PSMA2P25787 234 aa22.67■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 NFATC3Q12968 1075 aa22.67■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 COQ10AQ96MF6 247 aa22.67■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 SYT11Q9BT88 431 aa22.67■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 TEX33O43247 280 aa22.66■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 DAPK3O43293 454 aa22.66■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.66■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.66■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 PHF19Q5T6S3 580 aa22.65■■□□□ 1.22
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USP4-208ENST00000464168 NRROSQ86YC3 692 aa22.65■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.65■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.65■■□□□ 1.22
USP4-208ENST00000464168 SPOCK2Q92563 424 aa22.65■■□□□ 1.22
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