RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SEPT4O43236 478 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GSTT1P30711 240 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PTPRCAPQ14761 206 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PAOXQ6QHF9 649 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GALNT7Q86SF2 657 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TEX26Q8N6G2 289 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SEMA3CQ99985 751 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ARL5AQ9Y689 179 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 CRTAMO95727 393 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 RALGDSQ12967 914 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FBXO32Q969P5 355 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 OR1E1P30953 314 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 INHBCP55103 352 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CDH13P55290 713 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ARPP19P56211 112 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LRP8Q14114 963 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LAYNQ6UX15 382 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PTERQ96BW5 349 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CNBD2Q96M20 576 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TRMOQ9BU70 441 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.875e-6■■□□□ 11.4
IMP4-208ENST00000460766 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 GLP2RO95838 553 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PIRTP0C851 137 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ACVRL1P37023 503 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 GALNT3Q14435 633 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 RAB26Q9ULW5 256 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SLC12A8A0AV02 714 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PGM3O95394 542 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SLC26A3P40879 764 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 IL10RBQ08334 325 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SERINC3Q13530 473 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 IL23RQ5VWK5 629 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 IL31Q6EBC2 164 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 C19orf60Q96EN9 201 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MRASO14807 208 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 HERVK_113P63132 956 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 DSC1Q08554 894 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ZNF235Q14590 738 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 GEN1Q17RS7 908 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 UNC50Q53HI1 259 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SATL1Q86VE3 508 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TADA1Q96BN2 335 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MUSKO15146 869 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FLT3LGP49771 235 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PARP15Q460N3 678 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MFN1Q8IWA4 741 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.49■□□□□ 0.87
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