RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457926.5

AFG3L1P-215, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,919 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ESAM	Q96AP7	390 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LINC00032	P0C843	101 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	THPO	P40225	353 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RANBP1	P43487	201 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PFKP	Q01813	784 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	IKBKE	Q14164	716 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FUT11	Q495W5	492 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RETREG3	Q86VR2	466 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	C19orf60	Q96EN9	201 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	VPS28	Q9UK41	221 aa		18.65	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926		A0A1B0GTL3	188 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HAS3	O00219	553 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RHD	Q02161	417 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GRB7	Q14451	532 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DHFR2	Q86XF0	187 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ACBD6	Q9BR61	282 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GFAP	P14136	432 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HK2	P52789	917 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TSPY1	Q01534	308 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RPS6KA2	Q15349	733 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ISCA2	Q86U28	154 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NUP93	Q8N1F7	819 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TIMM22	Q9Y584	194 aa		18.64	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926		A0A0J9YYE9	177 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SLC22A2	O15244	555 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RBP1	P09455	135 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GNAO1	P09471	354 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MAP2K5	Q13163	448 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	AHI1	Q8N157	1196 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FAM47B	Q8NA70	645 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SMIM14	Q96QK8	99 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SOCS2	O14508	198 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PIP5K1B	O14986	540 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	AP1G1	O43747	822 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	STAMBP	O95630	424 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ATP6V1B2	P21281	511 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DNAJB2	P25686	324 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	APLP1	P51693	650 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FAM171B	Q6P995	826 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PADI3	Q9ULW8	664 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KDELC1	Q6UW63	502 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	EXOC2	Q96KP1	924 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		18.63	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MYLK	Q15746	1914 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926		A0A0U1RQS6	177 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926		H3BMM5	538 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ASL	P04424	464 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DNAJB13	P59910	316 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ACAP2	Q15057	778 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MAPRE2	Q15555	327 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	UNC50	Q53HI1	259 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CALML6	Q8TD86	181 aa		18.62	■□□□□ 0.57
AFG3L1P-215	ENST00000457926	VPS33A	Q96AX1	596 aa		18.62	■□□□□ 0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms