RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447046.1

AC004980.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.3, Length 365 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.3-201ENST00000447046 SEMA3BQ13214 749 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC12A1Q13621 1099 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 DPYSQ14117 519 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 STAT4Q14765 748 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TEX44Q53QW1 395 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MS4A13Q5J8X5 152 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MPP7Q5T2T1 576 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MARC1Q5VT66 337 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 BICRALQ6AI39 1079 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TRNP1Q6NT89 227 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC25Q86WR0 208 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CHSY1Q86X52 802 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 Q8N1Y9 231 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ATPAF2Q8N5M1 289 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PQLC3Q8N755 202 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 FBXO25Q8TCJ0 367 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CDKL2Q92772 493 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 E2F7Q96AV8 911 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HDAC11Q96DB2 347 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ASIC4Q96FT7 647 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 P2RY11Q96G91 374 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SPATA13Q96N96 652 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF599Q96NL3 588 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PEBP4Q96S96 227 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RNF32Q9H0A6 362 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EPC1Q9H2F5 836 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TLE6Q9H808 572 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 USP29Q9HBJ7 922 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 DTLQ9NZJ0 730 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 BFARQ9NZS9 450 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TTC3P53804 2025 aa5.21□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 A0A1B0GVM2 712 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 E2F8A0AVK6 867 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ILVBLA1L0T0 632 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 FITM1A5D6W6 292 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 H0Y626 953 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 H7BY64 318 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RASGRF2O14827 1237 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 DCLK1O15075 740 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PFDN6O15212 129 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 COCHO43405 550 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 KATNA1O75449 491 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IGLV3-27P01718 113 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 APRTP07741 180 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HMBSP08397 361 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NUDT17P0C025 328 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ATF6P18850 670 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TPSB2P20231 275 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TACR2P21452 398 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GABRR2P28476 465 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HOXC13P31276 330 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GDNFP39905 211 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NNMTP40261 264 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 VPS41P49754 854 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CLCN4P51793 760 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GEMP55040 296 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC7A9P82251 487 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TMPRSS15P98073 1019 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CYP4F8P98187 520 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CHRNEQ04844 493 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IL10RBQ08334 325 aa5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ITKQ08881 620 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms