RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IRF6O14896 467 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PMM2O15305 246 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TBX10O75333 385 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXC6P09630 235 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 AQP4P55087 323 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TGM3Q08188 693 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TAB1Q15750 504 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SDE2Q6IQ49 451 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LINGO1Q96FE5 620 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 COL20A1Q9P218 1284 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DERAQ9Y315 318 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PTPN9P43378 593 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ACTR3P61158 418 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SPIDRQ14159 915 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 GLYATQ6IB77 296 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 MTSS1LQ765P7 747 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 FLCNQ8NFG4 579 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 VPS35Q96QK1 796 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 OR52E6Q96RD3 313 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CACNA1FO60840 1977 aa11.21□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 NBNO60934 754 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PRKCQQ04759 706 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ENPEPQ07075 957 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 EXOC2Q96KP1 924 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 OLFM1Q99784 485 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 G3V2T6 193 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 GALNT3Q14435 633 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CDC73Q6P1J9 531 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DAW1Q8N136 415 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF567Q8N184 647 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CD101Q93033 1021 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 BBS4Q96RK4 519 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 EBF4Q9BQW3 602 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PAGE1O75459 146 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CSH1P0DML2 217 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CSH2P0DML3 217 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 NOS3P29474 1203 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 IFNGR2P38484 337 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 RPS6KA3P51812 740 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ARMC3Q5W041 872 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CBR4Q8N4T8 237 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 UBR7Q8N806 425 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PPM1MQ96MI6 270 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PANX1Q96RD7 426 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TK2O00142 265 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 RFXANKO14593 260 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SNPHO15079 494 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFRSF21O75509 655 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ALFQ53S48 1182 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 USP45Q70EL2 814 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PARP8Q8N3A8 854 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.2□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 LEMD2Q8NC56 503 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms