RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 AIF1P55008 147 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GSTM4Q03013 218 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MFSD10Q14728 455 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SPRED1Q7Z699 444 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OSTM1Q86WC4 334 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CYGBQ8WWM9 190 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NTAN1Q96AB6 310 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FEM1CQ96JP0 617 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF560Q96MR9 790 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SELENONQ9NZV5 590 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SOBPA7XYQ1 873 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SNAP91O60641 907 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BAIAP3O94812 1187 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCNA5P22460 613 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCT8P50990 548 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC12A2P55011 1212 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 STX1BP61266 288 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BNIP2Q12982 314 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LCN8Q6JVE9 175 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf87Q6PH81 154 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TLK2Q86UE8 772 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RETREG3Q86VR2 466 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FBXL20Q96IG2 436 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP42Q96MM3 310 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NRP1O14786 923 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BEST1O76090 585 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 JCHAINP01591 159 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 YWHAQP27348 245 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC1A2P43004 574 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CD151P48509 253 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 POU4F1Q01851 419 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SCAPQ12770 1279 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CSHL1Q14406 222 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 EML3Q32P44 896 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OGFOD2Q6N063 350 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RNF169Q8NCN4 708 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PTPN18Q99952 460 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MED10Q9BTT4 135 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 K7EPI3 171 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CAPN15O75808 1086 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 F2P00734 622 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FUCA1P04066 466 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HSD17B1P14061 328 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ARNTP27540 789 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ETFBP38117 255 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BNIP3Q12983 259 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TANKQ92844 425 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MYRFLQ96LU7 910 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CHST12Q9NRB3 414 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PLXNB2O15031 1838 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ACOX3O15254 700 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TPST1O60507 370 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CLIC3O95833 236 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GPX3P22352 226 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CAPGP40121 348 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LILRA4P59901 499 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 POU6F1Q14863 301 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 WSCD1Q658N2 575 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms