RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 CETPP11597 493 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 MCM3P25205 808 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 POU1F1P28069 291 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 NOVP48745 357 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 CENPAP49450 140 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 CDH15P55291 814 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 SLC18A2Q05940 514 aa3.3□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 TNFAIP1Q13829 316 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 MOB3CQ70IA8 216 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 RRM2BQ7LG56 351 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 GPAT4Q86UL3 456 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM160B2Q86V87 743 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.3□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.3□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 FIG4Q92562 907 aa3.3□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 C16orf97H3BN30 126 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 EXTL3O43909 919 aa3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 TAF11Q15544 211 aa3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 NUF2Q9BZD4 464 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 HSF4Q9ULV5 492 aa3.29□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 EBAG9O00559 213 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 TSPAN4O14817 238 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 GJC3Q8NFK1 279 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 HERVK_113Q902F9 699 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRDMT1-204ENST00000424636 C3orf30Q96M34 536 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDMT1-204ENST00000424636 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.28□□□□□ -1.88
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