RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM71Q6P5X7 295 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 CHST9Q7L1S5 443 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 GSTA5Q7RTV2 222 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 KRT77Q7Z794 578 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TDRPQ86YL5 185 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 GPSM1Q86YR5 675 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 LURAP1LQ8IV03 231 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 PELI3Q8N2H9 469 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM199Q8N511 208 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 SNAPC3Q92966 411 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 CALML4Q96GE6 196 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 C1orf74Q96LT6 269 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 YME1L1Q96TA2 773 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 MXRA8Q9BRK3 442 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 MXD3Q9BW11 206 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TKTL2Q9H0I9 626 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 KIF9Q9HAQ2 790 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 NDRG3Q9UGV2 375 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 A3GALT2U3KPV4 340 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 A0A1W2PPC1 479 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 A0A1W2PRQ8 180 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 A6NNC1 897 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 BTBD18B2RXH4 712 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 ATG13O75143 517 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 CLDN7O95471 211 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ADRB2P07550 413 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 FGF2P09038 288 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 MYZAPP0CAP1 466 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 SHMT1P34896 483 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 F2RL1P55085 397 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 STK4Q13043 487 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 ESCO2Q56NI9 601 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 SGO1Q5FBB7 561 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 RAB41Q5JT25 222 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 NOXA1Q86UR1 476 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 FAM217AQ8IXS0 508 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 RBFAQ8N0V3 343 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 TAGAPQ8N103 731 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 GJC3Q8NFK1 279 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 BICD2Q8TD16 824 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 PGAM5Q96HS1 289 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF333Q96JL9 665 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 FEM1CQ96JP0 617 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 SIN3AQ96ST3 1273 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 CDT1Q9H211 546 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 KLHL31Q9H511 634 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 SH2D4AQ9H788 454 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 FZD3Q9NPG1 666 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 MTMR6Q9Y217 621 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 LRP12Q9Y561 859 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-207ENST00000418674 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 P4HA2O15460 535 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 HCRTR2O43614 444 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ATP2C2O75185 946 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 NDUFS3O75489 264 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-207ENST00000418674 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
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