RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CILP2Q8IUL8 1156 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ELMOD1Q8N336 334 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LPCAT1Q8NF37 534 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 WFDC5Q8TCV5 224 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 AGR3Q8TD06 166 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BADQ92934 168 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SGF29Q96ES7 293 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OMDQ99983 421 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TCF25Q9BQ70 676 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EBF4Q9BQW3 602 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FEM1AQ9BSK4 669 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KLC4Q9NSK0 619 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK4Q9NYG8 393 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMCX1Q9P291 453 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP97Q9P2B7 532 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB3Q9Y575 518 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 INSL6Q9Y581 213 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RAI2Q9Y5P3 530 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP73A6NFT4 308 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HIDE1A8MVS5 230 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FCHO1O14526 889 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5HO75947 161 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPA4LO95757 839 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GLP2RO95838 553 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CD160O95971 181 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MT-CO1P00395 513 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GOT2P00505 430 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT16P08779 473 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS56P0CW18 603 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CR2P20023 1033 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CRABP2P29373 138 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CSKP41240 450 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NAGLUP54802 743 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 POU4F1Q01851 419 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CREMQ03060 361 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DLG1Q12959 904 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 USP4Q13107 963 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB5D1Q6P9G0 228 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LILRA6Q6PI73 481 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MFN1Q8IWA4 741 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PAF1Q8N7H5 531 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EFHBQ8N7U6 833 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM136AQ96C01 138 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SORT1Q99523 831 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OLFM1Q99784 485 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 WWP1Q9H0M0 922 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 XPR1Q9UBH6 696 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 VWA7Q9Y334 891 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BPTFQ12830 3046 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0U1RQS6 177 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LCHNA4D1U4 455 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 K7ERQ8 282 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK2AP1O14519 115 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GREM1O60565 184 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RFPL2O75678 378 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMPSTE24O75844 475 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL2O95198 593 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GLUD1P00367 558 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PRLP01236 227 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 APOA4P06727 396 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC166P0CW27 439 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 COL6A2P12110 1019 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PMLP29590 882 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CTNNB1P35222 781 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms