RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399237.6

RUNX1-204, Transcript of runt related transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene RUNX1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1-204ENST00000399237 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 ZBTB17Q13105 803 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 MTM1Q13496 603 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 NFATC4Q14934 902 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 TCEA2Q15560 299 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 PRRT3Q5FWE3 981 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 FATE1Q969F0 183 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 HDAC11Q96DB2 347 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 PDXPQ96GD0 296 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 LGR4Q9BXB1 951 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 CACNA1GO43497 2377 aa21.46■■□□□ 1.03
RUNX1-204ENST00000399237 ITPR1Q14643 2758 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TMEM202A6NGA9 273 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 H3BM21 787 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TOR1BO14657 336 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PRLP01236 227 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TSHRP16473 764 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 VIPR1P32241 457 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PEX5P50542 639 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 DAB2P98082 770 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PTK2BQ14289 1009 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 RFLNAQ6ZTI6 216 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 BBS5Q8N3I7 341 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PAF1Q8N7H5 531 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 CNTD1Q8N815 330 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ASXL3Q9C0F0 2248 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 RCCD1A6NED2 376 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ZNF487B1APH4 448 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 KCNK1O00180 336 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 MMP2P08253 660 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 CDK4P11802 303 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TNNT1P13805 278 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 CCNB1P14635 433 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 FECHP22830 423 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 MAGEA1P43355 309 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 MARCKSL1P49006 195 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ADCY2Q08462 1091 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ILKQ13418 452 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ACOX1Q15067 660 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 LRRC38Q5VT99 294 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 OR1E3Q8WZA6 343 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 NXPE2Q96DL1 559 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 OLFM3Q96PB7 478 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 CEP41Q9BYV8 373 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 FGF22Q9HCT0 170 aa21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 NEMP2A6NFY4 417 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ALPPL2P10696 532 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TRIM23P36406 574 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ETV3P41162 512 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 HK3P52790 923 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PPARDQ03181 441 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ITKQ08881 620 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 28.5
RUNX1-204ENST00000399237 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 FAXCQ5TGI0 409 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 DENND2CQ68D51 928 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 GUSBP11Q6P575 273 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 HID1Q8IV36 788 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 SLC35F3Q8IY50 421 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 SCRN2Q96FV2 425 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 TBATAQ96M53 351 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 IL12RB2Q99665 862 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 BOCQ9BWV1 1114 aa21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RUNX1-204ENST00000399237 SPASTQ9UBP0 616 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms