RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 E2F8A0AVK6 867 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HEATR9A2RTY3 570 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 KLF11O14901 512 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ATP9BO43861 1147 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPAG7O75391 227 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PMPCBO75439 489 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RHOCP08134 193 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ITGA2BP08514 1039 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA31D3P0C874 917 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ERVK-10P10266 1014 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TPH1P17752 444 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HLA-DPA1P20036 260 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CA4P22748 312 aa6.07□□□□□ -1.44
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C6orf48-208ENST00000395788 WEE1P30291 646 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CRHR1P34998 444 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CCR2P41597 374 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CD86P42081 329 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 POLD2P49005 469 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LIMK2P53671 638 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 OXCT1P55809 520 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ERVK-21P61565 698 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ARF5P84085 180 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CYP4F8P98187 520 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 DSC2Q02487 901 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC14Q15048 493 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CASC4Q6P4E1 433 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CES3Q6UWW8 571 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ELMOD1Q8N336 334 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 BBS5Q8N3I7 341 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 IPMKQ8NFU5 416 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF778Q96MU6 729 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RBBP8Q99708 897 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 APOL2Q9BQE5 337 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ASAH2Q9NR71 780 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 UBP1Q9NZI7 540 aa6.07□□□□□ -1.44
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C6orf48-208ENST00000395788 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PLLPQ9Y342 182 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PSAT1Q9Y617 370 aa6.07□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LEFTY2O00292 366 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GRM6O15303 877 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 INSIG1O15503 277 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SLC7A4O43246 635 aa6.06□□□□□ -1.44
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C6orf48-208ENST00000395788 LPXNO60711 386 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TBL1XO60907 577 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ADAM11O75078 769 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NEBLO76041 1014 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NDST3O95803 873 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GSRP00390 522 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PRLP01236 227 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PRKCGP05129 697 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 FGF1P05230 155 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 IRF1P10914 325 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN2P17706 415 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GLDCP23378 1020 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GABRB3P28472 473 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HADHAP40939 763 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RGRP47804 291 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CCT5P48643 541 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CSNK1DP48730 415 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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