RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C5orf60A6NFR6 353 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SOCS7O14512 581 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NDST3O95803 873 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IFNA14P01570 189 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SHBGP04278 402 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GNSP15586 552 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SEMA5AQ13591 1074 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 QPCTQ16769 361 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF280BQ86YH2 543 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDK20Q8IZL9 346 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DSELQ8IZU8 1212 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RIN3Q8TB24 985 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BPIFB1Q8TDL5 484 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASZ1Q8WWH4 475 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FIG4Q92562 907 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BTBD9Q96Q07 612 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SH3GL1Q99961 368 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARMC7Q9H6L4 198 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HMGXB4Q9UGU5 601 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MKL2Q9ULH7 1088 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SNX13Q9Y5W8 968 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CFAP73A6NFT4 308 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GCATO75600 419 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WDR47O94967 919 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRKCGP05129 697 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ITPKAP23677 461 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ECHS1P30084 290 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRAF2Q12933 501 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POTEHQ6S545 545 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BCO2Q9BYV7 579 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ATG10Q9H0Y0 220 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HAO1Q9UJM8 370 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHADO15335 359 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 INPPL1O15357 1258 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ALBP02768 609 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CES1P23141 567 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NTSP30990 170 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCNQ1P51787 676 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDH4P55283 916 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UBE2E3Q969T4 207 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TPD52L3Q96J77 140 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC38A3Q99624 504 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SYBUQ9NX95 663 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYH1P12882 1939 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RGS14O43566 566 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HCRTO43612 131 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR6A2O95222 327 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EPORP19235 508 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ACTR1BP42025 376 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ACTR1AP61163 376 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC153Q494R4 210 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GLMNQ92990 594 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HMCESQ96FZ2 354 aa12.08□□□□□ -0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CLCN5P51795 746 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BIKQ13323 160 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GRM3Q14832 879 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TEAD2Q15562 447 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM45BPQ6NSW5 357 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IRGCQ6NXR0 463 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C17orf64Q86WR6 236 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.08□□□□□ -0.485e-6■□□□□ 9.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM45AQ8TCE6 357 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SUSD3Q96L08 255 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MAGEH1Q9H213 219 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 URADA6NGE7 173 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 H0YGN5 161 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DCXO43602 365 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ALDH4A1P30038 563 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COPZ1P61923 177 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PEX6Q13608 980 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RASA2Q15283 850 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FGD3Q5JSP0 725 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DEPDC1Q5TB30 811 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms