RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 FFAR2O15552 330 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TAF10Q12962 218 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 DLG3Q92796 817 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CD101Q93033 1021 aa22.42■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.42■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 TLE6Q9H808 572 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CD84Q9UIB8 345 aa22.42■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 COPS8Q99627 209 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SGK2Q9HBY8 427 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WXM4 84 aa22.41■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 EPS8Q12929 822 aa22.41■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 RCN3Q96D15 328 aa22.41■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.4■■□□□ 1.18
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