RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326039.3

GRTP1-201, Transcript of growth hormone regulated TBC protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GRTP1, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1-201ENST00000326039 IFT43Q96FT9 208 aa20.62■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 COQ10AQ96MF6 247 aa20.62■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SMIM14Q96QK8 99 aa20.62■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 GLOD4Q9HC38 313 aa20.62■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.62■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 MTSS1O43312 755 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TJP3O95049 919 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ITGAVP06756 1048 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ALPIP09923 528 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CCDC175P0C221 793 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SPINK2P20155 84 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 LHCGRP22888 699 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 NFKBIAP25963 317 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 YPEL5P62699 121 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 INPP5AQ14642 412 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 NOMO1Q15155 1222 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 IRF4Q15306 451 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CNGA3Q16281 694 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ACTL9Q8TC94 416 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.61■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 A0A0J9YYE9 177 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 A0A0U1RQS6 177 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 KRT37O76014 449 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TRBC1P01850 177 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CA4P22748 312 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 GRK6P43250 576 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ACOX1Q15067 660 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CCDC181Q5TID7 509 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 USP45Q70EL2 814 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ACACBO00763 2458 aa20.6■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 H7C0C1 242 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CSF2P04141 144 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 RBL1P28749 1068 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ATP5OP48047 213 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 EPHB1P54762 984 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PTSQ03393 145 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 QPCTQ16769 361 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 GLRX5Q86SX6 157 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF567Q8N184 647 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SLC25A45Q8N413 288 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TRIB3Q96RU7 358 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 VAT1Q99536 393 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 APOOQ9BUR5 198 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 KLF15Q9UIH9 416 aa20.59■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PSMD11O00231 422 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 NRDCO43847 1150 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 DGKAP23743 735 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TRIM23P36406 574 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 FOXC1Q12948 553 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PTK2BQ14289 1009 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SLC14A2Q15849 920 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CDKN3Q16667 212 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PID1Q7Z2X4 250 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 LYSMD1Q96S90 227 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 CDC6Q99741 560 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.58■□□□□ 0.89
GRTP1-201ENST00000326039 SDC3O75056 442 aa20.57■□□□□ 0.88
GRTP1-201ENST00000326039 PIAS2O75928 621 aa20.57■□□□□ 0.88
GRTP1-201ENST00000326039 PCCBP05166 539 aa20.57■□□□□ 0.88
GRTP1-201ENST00000326039 ETV3P41162 512 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms