RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 LILRA2Q8N149 483 aa16.42■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CALML6Q8TD86 181 aa16.42■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PDP2Q9P2J9 529 aa16.42■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.42■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MROH6A6NGR9 719 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MUSKO15146 869 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 LDB2O43679 373 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ME2P23368 584 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEP78395 509 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 HERC3Q15034 1050 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 EXT2Q93063 718 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ARL5AQ9Y689 179 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 YWHAQP27348 245 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 FOLH1Q04609 750 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DSC1Q08554 894 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA3CQ99985 751 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ADA2Q9NZK5 511 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 VPS28Q9UK41 221 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CDH13P55290 713 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PRKCZQ05513 592 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MBTPS1Q14703 1052 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 KLC3Q6P597 504 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ISCA2Q86U28 154 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PTERQ96BW5 349 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RANBP9Q96S59 729 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 VPS45Q9NRW7 570 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGB4Q9UN71 923 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PPP6CO00743 305 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SUPT7LO94864 414 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS56P0CW18 603 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SLC2A3P11169 496 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ELNP15502 786 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TMED1Q13445 227 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT3Q14435 633 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ACAP2Q15057 778 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RGMBQ6NW40 437 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CHSY3Q70JA7 882 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TEX26Q8N6G2 289 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PLXNA3P51805 1871 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SLC12A8A0AV02 714 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 FBP2O00757 339 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ACOT8O14734 319 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SLC7A4O43246 635 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TAF10Q12962 218 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA3AQ14563 771 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TLR1Q15399 786 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SLC14A2Q15849 920 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 AGKQ53H12 422 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO32Q969P5 355 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35B4Q969S0 331 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 C8orf48Q96LL4 319 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RGS18Q9NS28 235 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 AK5Q9Y6K8 562 aa16.4■□□□□ 0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms