RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 HLA-DQB2P05538 268 aa25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ADRA1AP35348 466 aa25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 C19orf60Q96EN9 201 aa25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 EI24O14681 340 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 CBX3Q13185 183 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 GPR158Q5T848 1215 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 KCNA7Q96RP8 456 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 BDNFP23560 247 aa25.35■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 HACD2Q6Y1H2 254 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 TAC4Q86UU9 113 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 IFNEQ86WN2 208 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa25.35■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ADGRG5Q8IZF4 528 aa25.35■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 NCK1P16333 377 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 CDKN2DP55273 166 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 SH3BP2P78314 561 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 NEDD8Q15843 81 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ATP6AP1Q15904 470 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 UNC50Q53HI1 259 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 RNF34Q969K3 372 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 THAP11Q96EK4 314 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ZFP42Q96MM3 310 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 SH3GLB1Q9Y371 365 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 CSADQ9Y600 493 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 CES1P23141 567 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 CXCR3P49682 368 aa25.34■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ERO1BQ86YB8 467 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 HDAC10Q969S8 669 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 PCED1BQ96HM7 432 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 TSGA13Q96PP4 275 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 CDH7Q9ULB5 785 aa25.34■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 USP22Q9UPT9 525 aa25.34■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 COL1A2P08123 1366 aa25.34■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 CLOCKO15516 846 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 B4GAT1O43505 415 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 CCT8P50990 548 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 SLC39A8Q9C0K1 460 aa25.33■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 OR51F1A6NGY5 319 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.33■■□□□ 1.65
SENP3-201ENST00000321337 HECTD2Q5U5R9 776 aa25.33■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.33■■□□□ 1.65
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SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GTL3 188 aa25.33■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ARPC2O15144 300 aa25.33■■□□□ 1.64
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SENP3-201ENST00000321337 ABCD2Q9UBJ2 740 aa25.33■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 FADS3Q9Y5Q0 445 aa25.33■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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SENP3-201ENST00000321337 ADM5C9JUS6 153 aa25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 J3QRK9 145 aa25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 IMPDH1P20839 514 aa25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TGFBIQ15582 683 aa25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 FBXO48Q5FWF7 155 aa25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 NANOGP8Q6NSW7 305 aa25.32■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R14BQ96C90 147 aa25.32■■□□□ 1.64
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