RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 SNX25Q9H3E2 840 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 SYBUQ9NX95 663 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 ANKMY1Q9P2S6 941 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 SARDHQ9UL12 918 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 USP12O75317 370 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 HLCSP50747 726 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 IFITM3Q01628 133 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 DNASE1L3Q13609 305 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 DGKDQ16760 1214 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 OSTM1Q86WC4 334 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 LSMEM2Q8N112 164 aa24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PKDCC-201ENST00000294964 TPST1O60507 370 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SEC14L2O76054 403 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 C2P06681 752 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ALOX5P09917 674 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 INAVAQ3KP66 663 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 LIPMQ5VYY2 423 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 RAB2BQ8WUD1 216 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 CERS2Q96G23 380 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD34BA5PLL1 514 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 GMNNO75496 209 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 BCAT1P54687 386 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 STX5Q13190 355 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 NOTUMQ6P988 496 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 STRA8Q7Z7C7 330 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 CD320Q9NPF0 282 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 TIMM22Q9Y584 194 aa24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 COL1A2P08123 1366 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 KCNK1O00180 336 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 MLNP12872 115 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ARSAP15289 507 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 TGM1P22735 817 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 LIMK2P53671 638 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 RAD23AP54725 363 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 PLCL1Q15111 1095 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 TTC39CQ8N584 583 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 USP33Q8TEY7 942 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 IL22Q9GZX6 179 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 OAZ3Q9UMX2 235 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 PSMB4P28070 264 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SPRP35270 261 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ATP6AP1Q15904 470 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 URGCPQ8TCY9 931 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 PARVBQ9HBI1 364 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM181Q9P2C4 612 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 IFT52Q9Y366 437 aa24.69■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 B4GAT1O43505 415 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 MPOP05164 745 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 IFITM2Q01629 132 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 MORN1Q5T089 497 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ZYG11AQ6WRX3 759 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 APPL2Q8NEU8 664 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 STON2Q8WXE9 905 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 P2RY11Q96G91 374 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 ZFP42Q96MM3 310 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 SLC39A3Q9BRY0 314 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf16Q9BUW7 83 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 USP3Q9Y6I4 520 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 FAM72CH0Y354 149 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 RNF103O00237 685 aa24.68■■□□□ 1.54
PKDCC-201ENST00000294964 PIRO00625 290 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms