RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 C1QTNF8P60827 252 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 SEMA3AQ14563 771 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 GPNMBQ14956 572 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 ZNF549Q6P9A3 640 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 GK5Q6ZS86 529 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 ISCA2Q86U28 154 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 PGAM4Q8N0Y7 254 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 NPAS2Q99743 824 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 GSTO2Q9H4Y5 243 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 WDR41Q9HAD4 459 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 EFCAB1Q9HAE3 211 aa19.28■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 H7C4K7 107 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 PEX2P28328 305 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 SMARCB1Q12824 385 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 LAMB3Q13751 1172 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 ZNF423Q2M1K9 1284 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 PIGGQ5H8A4 983 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 FAM219BQ5XKK7 198 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 LHX8Q68G74 356 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 IL31Q6EBC2 164 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 MRNIPQ6NTE8 343 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 OR52K2Q8NGK3 314 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 BRSK1Q8TDC3 778 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 EXT2Q93063 718 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 PTERQ96BW5 349 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 VCXQ9H320 206 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 MEAF6Q9HAF1 191 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 SCOCQ9UIL1 159 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 TCAF2A6NFQ2 919 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 ACSL4O60488 711 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 TRPA1O75762 1119 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 TSPAN8P19075 237 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 IMPDH1P20839 514 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 SLC26A3P40879 764 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 DPP6P42658 865 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 GNA12Q03113 381 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 PDSS2Q86YH6 399 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 GATA6Q92908 595 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 ZNF599Q96NL3 588 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 TTPALQ9BTX7 342 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 NACA2Q9H009 215 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 CATSPERZQ9NTU4 200 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 DNMT3LQ9UJW3 386 aa19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP21-201ENST00000289865 EPOP01588 193 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 GALTP07902 379 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 HOXD10P28358 340 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 TRIP10Q15642 601 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 GSTA3Q16772 222 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 PPP1R3AQ16821 1122 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 ZNF678Q5SXM1 525 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 ANKS3Q6ZW76 656 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 GPR150Q8NGU9 434 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 SPON2Q9BUD6 331 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 KLHL4Q9C0H6 718 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 MAGEH1Q9H213 219 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 VCX3BQ9H321 246 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 VPS28Q9UK41 221 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 TBKBP1A7MCY6 615 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 ADAM12O43184 909 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 SUPT7LO94864 414 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 NDST3O95803 873 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 PRSS56P0CW18 603 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 CD1DP15813 335 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 MTA1Q13330 715 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 CEACAM7Q14002 265 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 TCTN1Q2MV58 587 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 C5orf22Q49AR2 442 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 SFT2D3Q587I9 215 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 CLEC6AQ6EIG7 209 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 CHSY3Q70JA7 882 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 BBS5Q8N3I7 341 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 RNF148Q8N7C7 305 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 OR4L1Q8NH43 312 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 PEX13Q92968 403 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 MGME1Q9BQP7 344 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 EBF3Q9H4W6 596 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 SUFUQ9UMX1 484 aa19.26■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 MAGEA13PA6NCF6 341 aa19.25■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 UBDO15205 165 aa19.25■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 SMIM24O75264 130 aa19.25■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 GJB5O95377 273 aa19.25■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 RPS24P62847 133 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
USP21-201ENST00000289865 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms