RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 MSCO60682 206 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 AP2A1O95782 977 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PRKCHP24723 683 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 DPYSQ14117 519 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LPPQ93052 612 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 NENFQ9UMX5 172 aa15.75■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
USP43-201ENST00000285199 UBXN8O00124 270 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 THP07101 528 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 FUT4P22083 530 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PRIM2P49643 509 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PRKG2Q13237 762 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 IKBKEQ14164 716 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 TMEM74Q96NL1 305 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 NUAK2Q9H093 628 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 C1orf21Q9H246 121 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 POLG2Q9UHN1 485 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PIP5K1BO14986 540 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MYO1DO94832 1006 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 ICAM3P32942 547 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 ECT2LQ008S8 904 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 RABL3Q5HYI8 236 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 COQ7Q99807 217 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SEMA3CQ99985 751 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 CHID1Q9BWS9 393 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SNPHO15079 494 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LRIG2O94898 1065 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MTHFRP42898 656 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 GNASQ5JWF2 1037 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 EPGNQ6UW88 154 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 GPSM1Q86YR5 675 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 OMA1Q96E52 524 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 HSFY1Q96LI6 401 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 OXSMQ9NWU1 459 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 EHD3Q9NZN3 535 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 ASB3Q9Y575 518 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LRRC37A3O60309 1634 aa15.74■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PMM2O15305 246 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MED26O95402 600 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 AHSGP02765 367 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SERPINF2P08697 491 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MLNP12872 115 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 RXRBP28702 533 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 INAQ16352 499 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MYO10Q9HD67 2058 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 A0A087X1B8 175 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 C9IYK1 514 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 RAMP2O60895 175 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 C5P01031 1676 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 GJA9P57773 515 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LAPTM4AQ15012 233 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 RRM2BQ7LG56 351 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SEPT8Q92599 483 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 POLE4Q9NR33 117 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 CDH9Q9ULB4 789 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 HALP42357 657 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LAPTM5Q13571 262 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MCFD2Q8NI22 146 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.73■□□□□ 0.11
USP43-201ENST00000285199 MATN2O00339 956 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms