RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 NEFHP12036 1026 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 CD70P32970 193 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 PLK1P53350 603 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 USP4Q13107 963 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF77Q15935 545 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 STYXQ8WUJ0 223 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 CCT6BQ92526 530 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 E2F7Q96AV8 911 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 TDP1Q9NUW8 608 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.77■□□□□ 0.28
FBXO4-201ENST00000281623 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ANHXE9PGG2 379 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CCL22O00626 93 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 HAUS5O94927 633 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TCF3P15923 654 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PSMA3P25788 255 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PRAMEP78395 509 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 IRF9Q00978 393 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 SLC12A1Q13621 1099 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 HTR4Q13639 388 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PCLAFQ15004 111 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC153Q494R4 210 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CES4AQ5XG92 561 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 GJD3Q8N144 294 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 FGF14Q92915 247 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 NXPE3Q969Y0 559 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 RMDN1Q96DB5 314 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TBATAQ96M53 351 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF358Q9NW07 568 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.76■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 K7ERQ8 282 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CRTAMO95727 393 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 FCARP24071 287 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 AP1S1P61966 158 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 IRX4P78413 519 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 BST1Q10588 318 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CHI3L2Q15782 390 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ATG16L1Q676U5 607 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CNSTQ6PJW8 725 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PARM1Q6UWI2 310 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 LCA5Q86VQ0 697 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 GPR150Q8NGU9 434 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 C10orf82Q8WW14 230 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 KCNK12Q9HB15 430 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 OR51F1A6NGY5 319 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 FZD6O60353 706 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ECI2O75521 394 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 ALDH3A1P30838 453 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 CLCN5P51795 746 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 RAB10P61026 200 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TMPRSS15P98073 1019 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PTPRCAPQ14761 206 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 MBLAC2Q68D91 279 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FBXO4-201ENST00000281623 TMEM25Q86YD3 366 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms