RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 TM7SF2O76062 418 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 AP2A1O95782 977 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 GAS8O95995 478 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 HLA-DPA1P20036 260 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 TERF1P54274 439 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPS1Q13098 491 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SGCGQ13326 291 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARHGEF7Q14155 803 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC66Q68CR7 880 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 C4orf22Q6V702 233 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYSMD1Q96S90 227 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PROB1E7EW31 1015 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPN2O95208 641 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 APRTP07741 180 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LMAN1P49257 510 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 C2orf54Q08AI8 447 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPP1R7Q15435 360 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT12Q99456 494 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.86■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLDN7O95471 211 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 FGF1P05230 155 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTGIRP43119 386 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC6Q16204 474 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SYT12Q8IV01 421 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLCO2A1Q92959 643 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC45Q96CN5 670 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SERAC1Q96JX3 654 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.85■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 WNT9AO14904 365 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAD51BO15315 384 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PSMD3O43242 534 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 RETP07949 1114 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 GM2AP17900 193 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 DR1Q01658 176 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ACOX1Q15067 660 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDKN3Q16667 212 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC6A18Q96N87 628 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 DMTF1Q9Y222 760 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC4A1P02730 911 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 MPLP40238 635 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTSQ03393 145 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF711Q9Y462 761 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.84■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.83■■□□□ 1.25
SIGMAR1-201ENST00000277010 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 AURKAO14965 403 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1SP09871 688 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF30P17039 623 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUDT1P36639 197 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 ETV3P41162 512 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 COQ10AQ96MF6 247 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 NCDNQ9UBB6 729 aa22.83■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 ESPNB1AK53 854 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 TTI1O43156 1089 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 SUN1O94901 812 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 AKT2P31751 481 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 GRIA1P42261 906 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLDN2P57739 230 aa22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SIGMAR1-201ENST00000277010 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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